利用CIRBP作為胰腺癌診斷及治療分子標記物(細胞增殖生長曲線檢測步驟)
RIP技術(RNABindingProteinImmunoprecipitation,RNA結(jié)合蛋白免疫沉淀),是研究細胞內(nèi)RNA與蛋白結(jié)合情況的技術。運用針對目標蛋白的抗體把相應的RNA-蛋白復合物沉淀下來,然后經(jīng)過分離純化就可以對結(jié)合在復合物上的RNA進行分析;即用抗體或表位標記物捕獲細胞核內(nèi)或細胞質(zhì)中內(nèi)源性的RNA結(jié)合蛋白,防止非特異性的RNA的結(jié)合,免疫沉淀把RNA結(jié)合蛋白及其結(jié)合的RNA一起分離出來,結(jié)合的RNA序列通過microarray(RIP-Chip),定量RT-PCR或高通量測序(RIP-Seq)方法來鑒定;目標蛋白是一種應激反應蛋白,在應激反應過程中,可以從細胞核遷移到細胞質(zhì),此外,目標蛋白還可以從細胞中分泌出來,在細胞外作為損傷相關分子模式發(fā)揮功能,促進炎癥反應,并在急性和慢性炎癥中發(fā)揮重要作用。
一種利用CIRBP作為胰腺癌診斷及治療分子標記物的方法,所述方法步驟包括如下:
步驟1:材料準備,準備試劑細胞培養(yǎng)試劑:胎牛血清,DMEM-高糖培養(yǎng)基,RPMI-1640培養(yǎng)基,青鏈霉素,PBS磷酸鉀緩沖液,Trypsin-EDTA(0.25%)phenol red以及實驗耗材6孔板細胞培養(yǎng)板,12孔板細胞培養(yǎng)板,24孔板細胞培養(yǎng)板,48孔板細胞培養(yǎng)板,96孔板細胞培養(yǎng)板,巴氏吸管;
步驟2:細胞復蘇,將水浴鍋預熱至37℃,用75%酒精擦拭紫外線照射30min的超凈工作臺臺面,在超凈工作臺中按次序擺放好消過毒的離心管、吸管、培養(yǎng)瓶等等,取出凍存管,迅速解凍,迅速將凍存管投入到已經(jīng)預熱的水浴鍋中迅速解凍,并要不斷的搖動,使管中的液體迅速融化,在凍存管內(nèi)還存在一點點沒融化的時候,取出,用酒精棉球擦拭凍存管的外壁,再拿入超凈臺內(nèi),制備細胞懸液,將細胞轉(zhuǎn)移至一個15ml離心管內(nèi),一滴一滴地加入預熱好的培養(yǎng)基,同時一邊晃動離心管;加入培養(yǎng)基的量要達到10ml以上,離心,在低速離心機上,以800rpm離心5分鐘;吸去上清,然后用1ml培養(yǎng)基重懸細胞,將細胞懸液分裝入培養(yǎng)皿內(nèi),將培養(yǎng)皿放入37℃含CO2的培養(yǎng)箱內(nèi)培養(yǎng),換液的時間由細胞沉降速度情況而定;
步驟3:細胞培養(yǎng),將水浴鍋預熱至37℃,用75%酒精擦拭紫外線照射30min的超凈工作臺臺面,在超凈工作臺中按次序擺放好消過毒的離心管、吸管、培養(yǎng)瓶等等,取出細胞培養(yǎng)瓶,無菌操作,打開瓶蓋,吸掉舊培養(yǎng)液,用PBS洗滌細胞一至二次,加入trypsin-EDTA溶液(1ml/25cm2,2ml/75cm2),輕洗細胞皿底部,吸掉trypsin-EDTA溶液,放入37℃培養(yǎng)箱2-3分鐘,輕拍培養(yǎng)瓶壁使大部分細胞脫落,于倒立顯微鏡下觀察,當細胞將要分離而呈現(xiàn)圓粒狀時,加入適量含血清之新鮮培養(yǎng)基終止trypsin作用;
步驟4:實驗分組,檢測項目為RIP檢測CIRBP調(diào)控TP53、、PCR檢測CIRBP、TP53、wb、CIRBP、ACSL4、PTGS2、NOX1、GPX4、FTH1、普魯士藍染色、激光共聚焦檢測線粒體活性氧ROS、谷胱甘肽GSH檢測、流式凋亡檢測、細胞增殖生長曲線檢測;
步驟4中細胞增殖生長曲線檢測步驟為a:取各處理組細胞進行下面實驗;b:消化細胞后吹打散細胞,計數(shù),調(diào)整細胞濃度為1×105個/ml,分到96孔板,每孔100ul,即每孔細胞為1×104個;c:貼壁細胞需待細胞貼壁后,再收集各時間點細胞進行檢測;d:收集各個時間點的細胞(0h,24h,48h,72h)加入CCK-8溶液(碧云天,Cat.No.C0037),比例為1/10。即100ul培養(yǎng)液加入10ul檢測液;e:在孵育4小時后,酶標儀讀板,CCK-8檢測讀取OD450數(shù)據(jù)。
步驟5:RIP檢測P CIRBP調(diào)控TP53。
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